ID4Gibbs™基于量子力学、分子力学、统计力学等物理原理,构建了自研分子力场XFF、结合模式预测XPose和亲和力预测XFEP流程,从精度、效率和通量上有力地支持FIC、BIC、FF等业务项目的分子设计、评估和优化。
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XFF-自研高精度分子力场
- 精度高
根据>50个真实管线应用反馈,对力场和算法进行了多轮迭代;
- 海量训练数据
已完成数亿核时,百万量级的量子化学计算以及数千次分子动力学模拟;
- 全面覆盖类药分子化学空间
多样化、针对性设计的内部训练集;
- 云平台部署
自动进行参数修正,可为客户化学空间定制专有力场开发。
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亲和力预测对比结果
QM vs MM构象能对比(>10万分子集)
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XPose攻克“不可成药靶点”
- 精度高
对接结果达到原子级精度(RMSD<1.0 Angstrom);
- 性能强
以实际项目体系进行训练和测试,更贴近实际项目需求;
- 柔性对接
对于小分子结合诱导氨基酸侧链构象变化的体系,能够准确预测小分子的结合模式,以及小分子结合后的位置和构象。
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XFEP高通量亲和力评估
- 精度高
预测活性误差在1个数量级以内;
- 效率高
可以在一周之内精确计算出5000-10000个小分子药物候选化合物和靶点的结合自由能;
- 通量高
其他同类商业方法的10-100倍;
- 功能全
涵盖药物设计大量实际场景需求,如耐药性和选择性预测,PROTAC分子、共价结合化合物、全新蛋白及短肽药物设计,基于片段/结构的骨架筛选、理性骨架设计和优化、官能团筛选、化合物结合构象验证等。